Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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