Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PLEKHA6-205ENST00000637508 5704 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TCF4-276ENST00000635822 7805 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 KRIT1-201ENST00000340022 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ESR1-201ENST00000206249 6458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SLC2A5-202ENST00000377424 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PFKFB3-203ENST00000379775 4483 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PKN2-203ENST00000370521 6121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 VWDE-206ENST00000614403 4701 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PCDHA4-204ENST00000618834 10557 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 OPRK1-206ENST00000613482 4682 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 GLUL-204ENST00000417584 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AC135012.1-201ENST00000563931 7430 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ENOX2-201ENST00000338144 4263 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 GOLGA8F-201ENST00000526619 5237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PAPLN-208ENST00000555445 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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