Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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NCF4Q15080 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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NCF4Q15080 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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NCF4Q15080 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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NCF4Q15080 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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NCF4Q15080 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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NCF4Q15080 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NCF4Q15080 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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