Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC3Q14574 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms