Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
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