Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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