Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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CDH18Q13634 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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CDH18Q13634 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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CDH18Q13634 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDH18Q13634 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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