Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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