Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTK7Q13308 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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