Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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