Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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NME3Q13232 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NME3Q13232 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NME3Q13232 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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