Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM32Q13049 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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