Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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