Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms