Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms