Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGM3Q08188 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms