Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
LRP1Q07954 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms