Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms