Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNG1Q06432 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CACNG1Q06432 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNG1Q06432 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNG1Q06432 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNG1Q06432 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNG1Q06432 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNG1Q06432 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms