Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SSBP1Q04837 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms