Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms