Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms