Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRX1P78414 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.05■□□□□ 0
IRX1P78414 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.05■□□□□ 0
IRX1P78414 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRX1P78414 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IRX1P78414 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRX1P78414 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IRX1P78414 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRX1P78414 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRX1P78414 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IRX1P78414 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRX1P78414 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IRX1P78414 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IRX1P78414 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRX1P78414 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IRX1P78414 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC15.05■□□□□ 0
IRX1P78414 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRX1P78414 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRX1P78414 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRX1P78414 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms