Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms