Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms