Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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USP46P62068 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP46P62068 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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