Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms