Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGGT1BP53609 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGGT1BP53609 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGGT1BP53609 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms