Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF6P49848 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF6P49848 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF6P49848 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms