Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCT5P48643 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCT5P48643 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCT5P48643 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCT5P48643 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCT5P48643 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCT5P48643 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCT5P48643 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCT5P48643 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CCT5P48643 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT5P48643 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT5P48643 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms