Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms