Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms