Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms