Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A1P43005 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms