Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms