Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms