Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1033.9 ms