Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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