Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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