Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms