Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP4AP20648 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms