Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN1P18031 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms