Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFLP07196 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEFLP07196 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEFLP07196 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEFLP07196 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFLP07196 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFLP07196 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFLP07196 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFLP07196 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFLP07196 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFLP07196 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFLP07196 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFLP07196 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFLP07196 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFLP07196 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFLP07196 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFLP07196 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFLP07196 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFLP07196 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFLP07196 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFLP07196 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFLP07196 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFLP07196 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFLP07196 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFLP07196 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFLP07196 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFLP07196 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFLP07196 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFLP07196 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFLP07196 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFLP07196 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFLP07196 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms