Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms