Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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CLDN9O95484 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CLDN9O95484 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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CLDN9O95484 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CLDN9O95484 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CLDN9O95484 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CLDN9O95484 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CLDN9O95484 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CLDN9O95484 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CLDN9O95484 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLDN9O95484 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLDN9O95484 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLDN9O95484 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLDN9O95484 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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