Protein–RNA interactions for Protein: O94844

RHOBTB1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB1O94844 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBTB1O94844 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms