Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms