Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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HOXA3O43365 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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HOXA3O43365 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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HOXA3O43365 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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HOXA3O43365 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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HOXA3O43365 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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HOXA3O43365 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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