Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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