Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FANCAO15360 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCAO15360 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCAO15360 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCAO15360 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCAO15360 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCAO15360 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCAO15360 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCAO15360 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCAO15360 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCAO15360 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCAO15360 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCAO15360 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCAO15360 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCAO15360 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCAO15360 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCAO15360 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCAO15360 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCAO15360 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCAO15360 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCAO15360 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCAO15360 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCAO15360 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCAO15360 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCAO15360 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCAO15360 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCAO15360 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCAO15360 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCAO15360 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCAO15360 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCAO15360 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCAO15360 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCAO15360 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCAO15360 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCAO15360 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCAO15360 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCAO15360 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCAO15360 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCAO15360 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCAO15360 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCAO15360 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms